source: orange/orange/doc/networks/leu_huttenhower_a.net @ 9588:a97bb6f03bc5

Revision 9588:a97bb6f03bc5, 17.3 KB checked in by Lan Zagar <lan.zagar@…>, 2 years ago (diff)

Added .hgeol and converted some line endings.

Line 
1### This file was generated with Orange Network Visualizer ###
2
3
4*Network "Leukemia genes connected by Huttenhower score"
5
6*Description "The similarity between genes as computed by Huttenhower et al., 2009 using the information on all publicly available gene expression and protein interaction data, combined with prior knowledge from the Gene Ontology, KEGG, HPRD and other biological data bases. The threshold for similarity was set to 0.999."
7
8*Vertices     240
9       1 "ACTA2"    0.0956    -0.4928    0.5000
10       2 "ACTN1"    0.3104    0.3324    0.5000 
11       3 "ADA"  -0.3516    -0.0925    0.5000   
12       4 "ADAM15"   0.3024    0.0647    0.5000 
13       5 "AHR"  -0.3776    -0.4040    0.5000   
14       6 "AKT1"     0.5658    -0.1715    0.5000
15       7 "ANXA1"    -0.1830    0.4628    0.5000
16       8 "ANXA2"    -0.4126    -0.2627    0.5000   
17       9 "APC"  0.5086    0.4118    0.5000 
18      10 "AREG"     -0.2586    -0.2683    0.5000   
19      11 "ARPC1B"   -0.3171    0.4738    0.5000
20      12 "ARPC2"    -0.2855    0.4422    0.5000
21      13 "ATRX"     -0.6023    -0.4192    0.5000   
22      14 "BARD1"    -0.3590    -0.0502    0.5000   
23      15 "BCL2"     0.5422    -0.2409    0.5000
24      16 "BCL3"     -0.2969    -0.0248    0.5000   
25      17 "BLK"  0.3757    -0.2419    0.5000
26      18 "BRF1"     -0.2533    -0.1424    0.5000   
27      19 "CALR"     0.4840    0.0438    0.5000 
28      20 "CAPN2"    -0.1854    0.5515    0.5000
29      21 "CAPNS1"   -0.2157    0.5842    0.5000
30      22 "CAST"     -0.2486    0.6144    0.5000
31      23 "CBX1"     -0.5380    -0.3037    0.5000   
32      24 "CBX3"     -0.5628    -0.3268    0.5000   
33      25 "CBX5"     -0.5116    -0.2835    0.5000   
34      26 "CCL5"     0.2242    -0.1219    0.5000
35      27 "CCND3"    -0.3246    -0.2484    0.5000   
36      28 "CCNG2"    -0.6551    0.0899    0.5000
37      29 "CCR1"     0.1903    -0.0929    0.5000
38      30 "CCT3"     -0.6774    -0.0436    0.5000   
39      31 "CCT4"     -0.6423    -0.0811    0.5000   
40      32 "CCT5"     -0.6626    0.0056    0.5000
41      33 "CCT7"     -0.7275    -0.0554    0.5000   
42      34 "CD14"     0.3262    0.0062    0.5000 
43      35 "CD19"     0.4359    -0.3075    0.5000
44      36 "CD1D"     0.4429    0.0612    0.5000 
45      37 "CD22"     0.4337    -0.3540    0.5000
46      38 "CD44"     0.1502    -0.0505    0.5000
47      39 "CD79A"    0.4604    -0.2691    0.5000
48      40 "CD79B"    0.4149    -0.2670    0.5000
49      41 "CD81"     0.0291    0.6669    0.5000 
50      42 "CD9"  -0.0122    0.6501    0.5000
51      43 "CDC6"     -0.3495    -0.3196    0.5000   
52      44 "CDC7"     -0.2689    -0.4090    0.5000   
53      45 "CES1"     -0.2140    0.1931    0.5000
54      46 "CFLAR"    -0.5032    0.4373    0.5000
55      47 "CLCNKA"   0.3810    -0.4207    0.5000
56      48 "CLCNKB"   0.4206    -0.4411    0.5000
57      49 "CLU"  -0.5352    -0.1974    0.5000   
58      50 "CNN1"     0.0827    -0.6525    0.5000
59      51 "CNN3"     0.0406    -0.6377    0.5000
60      52 "COL14A1"  0.1947    -0.0530    0.5000
61      53 "COL1A1"   0.0938    -0.0463    0.5000
62      54 "COPS5"    -0.4820    0.0249    0.5000
63      55 "CSF3R"    0.1908    0.0763    0.5000 
64      56 "CSNK1D"   -0.2251    -0.1857    0.5000   
65      57 "CSTA"     0.0102    0.3307    0.5000 
66      58 "CTBP1"    -0.3457    -0.2867    0.5000   
67      59 "CTNNB1"   0.4803    0.4548    0.5000 
68      60 "CTSD"     0.0887    0.4636    0.5000 
69      61 "CTSG"     0.2727    -0.2835    0.5000
70      62 "CTSH"     0.0250    0.2886    0.5000 
71      63 "CXCL1"    0.0131    -0.2908    0.5000
72      64 "CXCL2"    -0.0225    -0.3175    0.5000   
73      65 "CXCL3"    -0.0279    -0.2732    0.5000   
74      66 "CYBA"     0.0962    0.2703    0.5000 
75      67 "DNTT"     -0.4489    -0.2200    0.5000   
76      68 "E2F5"     -0.2257    -0.6885    0.5000   
77      69 "EED"  -0.5074    -0.4592    0.5000   
78      70 "ELL"  -0.2442    -0.2202    0.5000   
79      71 "ERG"  0.2485    -0.4255    0.5000
80      72 "ETF1"     -0.6641    0.2018    0.5000
81      73 "EZH2"     -0.5579    -0.4036    0.5000   
82      74 "FADD"     -0.4790    0.3998    0.5000
83      75 "FBP1"     0.2795    0.2929    0.5000 
84      76 "FCER2"    0.2205    -0.1083    0.5000
85      77 "FCGR1A"   0.2408    0.0147    0.5000 
86      78 "FDPS"     0.5959    -0.0950    0.5000
87      79 "FES"  -0.3334    0.0059    0.5000
88      80 "FGFR1"    0.5859    -0.0514    0.5000
89      81 "FGG"  0.3973    -0.0474    0.5000
90      82 "FKBP8"    0.5002    -0.2556    0.5000
91      83 "FLI1"     0.2678    -0.4658    0.5000
92      84 "FLNA"     0.2822    0.6043    0.5000 
93      85 "FLNB"     0.2377    0.6070    0.5000 
94      86 "FOSB"     -0.5316    0.0989    0.5000
95      87 "FOSL2"    -0.5239    0.1358    0.5000
96      88 "FTH1"     0.0084    0.4978    0.5000 
97      89 "FTL"  -0.0362    0.4988    0.5000
98      90 "GATA1"    0.2928    -0.5026    0.5000
99      91 "GATA2"    -0.2598    -0.3105    0.5000   
100      92 "GJB1"     0.2218    -0.5798    0.5000
101      93 "GJB2"     0.2002    -0.5410    0.5000
102      94 "GM2A"     0.6070    0.1583    0.5000 
103      95 "GNAI2"    -0.1177    -0.2274    0.5000   
104      96 "GPX1"     -0.0535    0.5886    0.5000
105      97 "GPX4"     -0.0468    0.5446    0.5000
106      98 "GRN"  0.2189    0.2118    0.5000 
107      99 "GUSB"     -0.2561    0.2078    0.5000
108     100 "HARS"     -0.6754    -0.1337    0.5000   
109     101 "HCK"  0.2467    0.0705    0.5000 
110     102 "HDAC2"    -0.4488    -0.4627    0.5000   
111     103 "HEXA"     0.5649    0.1435    0.5000 
112     104 "HFE"  -0.2313    -0.3904    0.5000   
113     105 "HK3"  0.2336    0.1698    0.5000 
114     106 "HMGB1"    -0.3019    -0.2880    0.5000   
115     107 "HOXA9"    -0.4024    0.0624    0.5000
116     108 "HSPA5"    -0.5499    -0.4622    0.5000   
117     109 "ICAM1"    0.3505    -0.0445    0.5000
118     110 "ICAM2"    0.3066    -0.0851    0.5000
119     111 "ICAM3"    0.2736    0.0231    0.5000 
120     112 "ID3"  -0.2659    -0.4681    0.5000   
121     113 "IFI16"    -0.2678    -0.1797    0.5000   
122     114 "IGBP1"    -0.6036    0.1504    0.5000
123     115 "IL13RA1"  0.4307    0.2615    0.5000 
124     116 "ILF2"     -0.4306    -0.1338    0.5000   
125     117 "IRS1"     0.5507    -0.3891    0.5000
126     118 "ITGA4"    -0.5282    -0.5032    0.5000   
127     119 "ITGAM"    0.2416    -0.0218    0.5000
128     120 "ITGAX"    0.2421    -0.0620    0.5000
129     121 "ITGB2"    0.2918    -0.0324    0.5000
130     122 "JUNB"     -0.4830    0.1003    0.5000
131     123 "JUP"  0.5033    0.5007    0.5000 
132     124 "LBR"  -0.5205    -0.3465    0.5000   
133     125 "LMNA"     -0.4368    -0.3772    0.5000   
134     126 "LMNB1"    -0.4827    -0.3735    0.5000   
135     127 "MAPKAPK3"     -0.3273    -0.5327    0.5000   
136     128 "MAX"  -0.4113    -0.0262    0.5000   
137     129 "MCL1"     -0.4477    -0.1808    0.5000   
138     130 "MCM2"     -0.2932    -0.4326    0.5000   
139     131 "MCM3"     -0.3039    -0.3879    0.5000   
140     132 "MCM6"     -0.3271    -0.4335    0.5000   
141     133 "MCM7"     -0.3294    -0.3839    0.5000   
142     134 "MEF2A"    -0.5161    0.0111    0.5000
143     135 "MEF2C"    -0.5644    -0.0078    0.5000   
144     136 "MITF"     -0.5128    -0.0995    0.5000   
145     137 "MKI67"    -0.5756    -0.2769    0.5000   
146     138 "MMP2"     0.0449    -0.0915    0.5000
147     139 "MSH2"     -0.3944    -0.1095    0.5000   
148     140 "MSH6"     -0.3925    -0.1511    0.5000   
149     141 "MT1A"     -0.1399    -0.0839    0.5000   
150     142 "MT1B"     -0.1383    -0.1285    0.5000   
151     143 "MT2A"     -0.1334    -0.1728    0.5000   
152     144 "MYL1"     0.0807    -0.4507    0.5000
153     145 "NCF2"     0.0959    0.2258    0.5000 
154     146 "NCL"  -0.2849    -0.1410    0.5000   
155     147 "NEUROD2"  0.3197    0.4210    0.5000 
156     148 "NFE2L1"   -0.4477    0.1391    0.5000
157     149 "NFKB1"    -0.2672    -0.0536    0.5000   
158     150 "NFKB2"    -0.2429    -0.0471    0.5000   
159     151 "NFKBIA"   -0.2654    -0.1063    0.5000   
160     152 "NPM1"     -0.2090    -0.1294    0.5000   
161     153 "NR3C1"    -0.3416    -0.1297    0.5000   
162     154 "NRIP1"    -0.3286    -0.2132    0.5000   
163     155 "NUCB1"    -0.1585    -0.2450    0.5000   
164     156 "P4HB"     0.1210    0.0036    0.5000 
165     157 "PAFAH1B1"     -0.5585    -0.3561    0.5000   
166     158 "PAFAH1B3"     -0.5858    -0.3913    0.5000   
167     159 "PARP1"    -0.3593    -0.1913    0.5000   
168     160 "PAX6"     -0.5681    -0.0968    0.5000   
169     161 "PCNA"     -0.4012    -0.2171    0.5000   
170     162 "PHB"  -0.3709    -0.2710    0.5000   
171     163 "PIK3R2"   0.5926    -0.3744    0.5000
172     164 "PIM1"     -0.6090    -0.3574    0.5000   
173     165 "PKN1"     0.2885    0.3815    0.5000 
174     166 "PLAUR"    0.2525    0.1264    0.5000 
175     167 "PLEC1"    0.3460    0.5343    0.5000 
176     168 "POLD2"    -0.4618    -0.2494    0.5000   
177     169 "PPBP"     0.2579    -0.2415    0.5000
178     170 "PPP1CC"   -0.7156    0.1414    0.5000
179     171 "PPP2CA"   -0.6595    0.1459    0.5000
180     172 "PRKCI"    -0.1020    -0.5627    0.5000   
181     173 "PRKDC"    -0.4099    -0.1769    0.5000   
182     174 "PSAP"     0.1308    0.4784    0.5000 
183     175 "PSMA2"    -0.6324    0.0102    0.5000
184     176 "PSMA6"    -0.6744    -0.0046    0.5000   
185     177 "PSME1"    -0.4888    0.1775    0.5000
186     178 "PSME2"    -0.5036    0.2196    0.5000
187     179 "PTGS2"    -0.2070    -0.2186    0.5000   
188     180 "PTMA"     -0.3741    -0.2338    0.5000   
189     181 "PTPN1"    0.5714    -0.2158    0.5000
190     182 "RAG1"     0.3822    -0.4999    0.5000
191     183 "RAG2"     0.3674    -0.5420    0.5000
192     184 "RARA"     -0.2885    -0.2545    0.5000   
193     185 "RB1"  -0.3744    -0.3424    0.5000   
194     186 "RBBP4"    -0.4091    -0.4238    0.5000   
195     187 "RBL2"     -0.1838    -0.6738    0.5000   
196     188 "REL"  -0.2054    -0.0405    0.5000   
197     189 "RELB"     -0.2446    -0.0013    0.5000   
198     190 "RIPK1"    -0.5278    0.4744    0.5000
199     191 "RPA1"     -0.3403    -0.1647    0.5000   
200     192 "RPSA"     -0.5505    -0.2416    0.5000   
201     193 "S100A10"  -0.4530    -0.2896    0.5000   
202     194 "S100A11"  -0.1801    0.5074    0.5000
203     195 "S100A8"   -0.0845    0.2042    0.5000
204     196 "S100A9"   -0.0680    0.1627    0.5000
205     197 "SDCBP"    -0.4972    0.3299    0.5000
206     198 "SHC1"     0.5714    -0.0093    0.5000
207     199 "SMAD4"    -0.4514    0.0386    0.5000
208     200 "SMARCA4"  -0.4285    -0.3044    0.5000   
209     201 "SNRPE"    -0.6624    -0.0892    0.5000   
210     202 "SNRPF"    -0.7045    -0.0744    0.5000   
211     203 "SOX4"     -0.5181    0.3693    0.5000
212     204 "SP3"  -0.4338    -0.5094    0.5000   
213     205 "SPARC"    0.1123    -0.0968    0.5000
214     206 "SPI1"     -0.2447    -0.3562    0.5000   
215     207 "SPIB"     -0.3051    -0.3443    0.5000   
216     208 "SPTAN1"   0.3246    0.4952    0.5000 
217     209 "SQSTM1"   -0.1422    -0.5436    0.5000   
218     210 "STAT3"    -0.3207    -0.0593    0.5000   
219     211 "STMN1"    -0.5862    -0.4882    0.5000   
220     212 "STXBP2"   0.6262    0.2688    0.5000 
221     213 "SUMO1"    -0.4376    -0.0922    0.5000   
222     214 "TARS"     -0.7125    -0.1092    0.5000   
223     215 "TAX1BP3"  0.4289    0.4517    0.5000 
224     216 "TCF12"    -0.2405    -0.5530    0.5000   
225     217 "TCF3"     -0.2789    -0.5182    0.5000   
226     218 "TCF4"     -0.2380    -0.5059    0.5000   
227     219 "TCL1A"    0.5600    -0.1274    0.5000
228     220 "TDG"  -0.4826    -0.0714    0.5000   
229     221 "TERF2"    -0.5085    -0.1631    0.5000   
230     222 "TFRC"     -0.2728    -0.3743    0.5000   
231     223 "TGFB1"    0.0839    -0.1303    0.5000
232     224 "TGFBI"    0.0620    -0.0039    0.5000
233     225 "THBS1"    -0.0006    -0.0658    0.5000   
234     226 "TIMP2"    0.0106    -0.1366    0.5000
235     227 "TLE1"     -0.2235    -0.3061    0.5000   
236     228 "TMPO"     -0.4411    -0.3439    0.5000   
237     229 "TOP2B"    -0.4480    -0.0465    0.5000   
238     230 "TP53"     -0.2930    -0.1935    0.5000   
239     231 "TSN"  -0.7167    -0.2512    0.5000   
240     232 "TSNAX"    -0.6790    -0.2753    0.5000   
241     233 "TYK2"     0.3902    0.2428    0.5000 
242     234 "UBTF"     -0.3909    -0.3688    0.5000   
243     235 "VAMP2"    0.5920    0.2974    0.5000 
244     236 "VASP"     0.4012    0.3481    0.5000 
245     237 "VIM"  0.2383    0.3847    0.5000 
246     238 "XRCC6"    -0.4792    -0.2085    0.5000   
247     239 "ZAP70"    0.5526    0.0312    0.5000 
248     240 "ZYX"  0.3606    0.3293    0.5000 
249*Edges
250       1      144 0.000293
251       2       75 0.000839
252       2      165 0.000206
253       2      240 0.000057
254       3      153 0.000200
255       4      101 0.000026
256       5      185 0.000596
257       6      181 0.000413
258       6      219 0.000001
259       7      194 0.000033
260       8      161 0.000677
261       8      162 0.000002
262       8      193 0.000035
263       9       59 0.000020
264      10       27 0.000831
265      11       12 0.000151
266      13       73 0.000051
267      14       16 0.000294
268      14      139 0.000173
269      15       82 0.000036
270      16      149 0.000001
271      16      150 0.000096
272      17       40 0.000766
273      18      230 0.000264
274      19       36 0.000894
275      20       21 0.000088
276      21       22 0.000110
277      23       24 0.000028
278      23       25 0.000368
279      24       25 0.000044
280      24      124 0.000000
281      24      137 0.000003
282      24      164 0.000348
283      25      124 0.000000
284      25      137 0.000001
285      25      192 0.000493
286      25      200 0.000065
287      25      238 0.000000
288      26       29 0.000007
289      27      161 0.000274
290      27      184 0.000002
291      28      171 0.000286
292      30       31 0.000318
293      30       32 0.000085
294      30       33 0.000043
295      34      121 0.000003
296      35       37 0.000099
297      35       39 0.000314
298      35       40 0.000341
299      38       52 0.000104
300      38       53 0.000223
301      39       40 0.000081
302      41       42 0.000009
303      43      131 0.000015
304      43      133 0.000113
305      43      161 0.000490
306      44      130 0.000001
307      44      131 0.000009
308      44      133 0.000255
309      45       99 0.000159
310      46       74 0.000000
311      46      190 0.000898
312      47       48 0.000000
313      49      238 0.000041
314      50       51 0.000222
315      53      138 0.000012
316      53      156 0.000226
317      53      205 0.000036
318      53      224 0.000039
319      54      199 0.000000
320      55      101 0.000317
321      56      230 0.000272
322      57       62 0.000005
323      58      154 0.000002
324      58      185 0.000170
325      59      123 0.000174
326      59      215 0.000099
327      60      174 0.000002
328      61      169 0.000036
329      63       64 0.000008
330      63       65 0.000003
331      64       65 0.000009
332      66      145 0.000155
333      67      161 0.000083
334      67      238 0.000332
335      68      187 0.000809
336      69       73 0.000000
337      69      102 0.000005
338      69      118 0.000111
339      70      230 0.000003
340      71       83 0.000007
341      72      171 0.000007
342      76      120 0.000016
343      77      101 0.000007
344      78       80 0.000006
345      79      210 0.000234
346      80      198 0.000432
347      81      109 0.000184
348      83       90 0.000000
349      84       85 0.000011
350      86       87 0.000330
351      86      122 0.000039
352      87      122 0.000001
353      88       89 0.000006
354      91      184 0.000042
355      91      206 0.000038
356      92       93 0.000005
357      94      103 0.000138
358      95      155 0.000000
359      96       97 0.000237
360      98      105 0.000000
361     100      214 0.000044
362     101      166 0.000034
363     102      186 0.000365
364     102      204 0.000223
365     104      222 0.000008
366     106      185 0.000009
367     106      227 0.000748
368     106      230 0.000000
369     107      199 0.000993
370     108      211 0.000279
371     109      121 0.000037
372     110      121 0.000000
373     111      121 0.000287
374     112      217 0.000045
375     112      218 0.000000
376     113      230 0.000669
377     114      171 0.000148
378     115      233 0.000911
379     116      173 0.000115
380     117      163 0.000500
381     119      120 0.000717
382     119      121 0.000265
383     120      121 0.000096
384     122      148 0.000149
385     122      199 0.000755
386     124      126 0.000019
387     125      126 0.000000
388     125      185 0.000067
389     126      228 0.000002
390     127      217 0.000054
391     128      139 0.000000
392     128      199 0.000074
393     129      161 0.000321
394     130      131 0.000000
395     130      132 0.000000
396     130      133 0.000000
397     131      132 0.000000
398     131      133 0.000000
399     132      133 0.000000
400     133      185 0.000001
401     134      135 0.000162
402     134      199 0.000012
403     136      160 0.000043
404     136      213 0.000327
405     138      223 0.000069
406     138      225 0.000002
407     138      226 0.000000
408     139      140 0.000000
409     139      161 0.000004
410     140      161 0.000005
411     141      142 0.000350
412     142      143 0.000507
413     146      152 0.000000
414     146      153 0.000831
415     146      230 0.000264
416     147      165 0.000080
417     149      150 0.000101
418     149      151 0.000000
419     149      188 0.000003
420     149      189 0.000804
421     149      210 0.000954
422     150      151 0.000730
423     150      188 0.000004
424     150      189 0.000001
425     151      230 0.000003
426     153      154 0.000000
427     153      210 0.000020
428     153      213 0.000154
429     153      230 0.000071
430     154      184 0.000911
431     155      179 0.000005
432     157      158 0.000281
433     159      161 0.000065
434     159      173 0.000273
435     159      230 0.000061
436     161      168 0.000079
437     161      180 0.000034
438     161      238 0.000024
439     162      185 0.000006
440     162      200 0.000007
441     162      230 0.000067
442     165      237 0.000001
443     167      208 0.000811
444     170      171 0.000734
445     172      209 0.000001
446     173      191 0.000005
447     173      238 0.000039
448     175      176 0.000405
449     177      178 0.000000
450     179      230 0.000654
451     182      183 0.000808
452     185      186 0.000007
453     185      200 0.000118
454     185      207 0.000666
455     185      228 0.000861
456     185      234 0.000345
457     191      230 0.000007
458     195      196 0.000005
459     197      203 0.000297
460     198      239 0.000861
461     201      202 0.000000
462     205      223 0.000149
463     206      207 0.000283
464     212      235 0.000289
465     213      220 0.000000
466     213      229 0.000004
467     216      217 0.000017
468     216      218 0.000707
469     217      218 0.000063
470     221      238 0.000014
471     231      232 0.000001
472     236      240 0.000000
473
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.