Changeset 1580:c4da7dfaf4db in orange-bioinformatics


Ignore:
Timestamp:
02/23/12 10:58:44 (2 years ago)
Author:
ales_erjavec
Branch:
default
rebase_source:
39cf00e60398c98290a1dda43f6d72059d56e740
Message:

Use Orange buffer dir for obiKEGG2 files.

File:
1 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • obiKEGG2/conf.py

    r1547 r1580  
    99import ConfigParser 
    1010from StringIO import StringIO 
    11  
     11from Orange.misc import serverfiles 
     12kegg_dir = serverfiles.localpath("KEGG2") 
    1213 
    1314default = """ 
    1415[cache] 
    15 path = %(home)s/.obiKEGG/ 
     16# path = %(home)s/.obiKEGG/ 
     17path = %(kegg_dir)s/ 
    1618store = sqlite3 
    1719kegg_invalidate = always 
     
    2325""" 
    2426 
    25 #_defaults_env = dict(default) 
    26 #_defaults_env.update(dict(os.environ)) 
     27# Orange kegg files dir 
     28env = dict(os.environ) 
     29env["kegg_dir"] = kegg_dir 
    2730 
    28 parser = ConfigParser.ConfigParser(dict(os.environ))#_defaults_env) 
    29 # TODO: global settings 
     31parser = ConfigParser.ConfigParser(env) 
     32 
    3033 
    3134parser.readfp(StringIO(default), "default") 
    3235 
     36# TODO: global settings rc file 
    3337parser.read([os.path.expanduser("~/.obiKEGG/rc.cfg")]) 
    3438 
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.